Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GemP55041 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GemP55041 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GemP55041 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GemP55041 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GemP55041 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GemP55041 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GemP55041 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GemP55041 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GemP55041 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GemP55041 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms