Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NrlP54846 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NrlP54846 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrlP54846 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrlP54846 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrlP54846 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrlP54846 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms