Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacnb3P54285 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms