Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fdft1P53798 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fdft1P53798 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms