Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RabggtbP53612 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms