Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Map3k1P53349 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Map3k1P53349 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms