Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp1P52624 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp1P52624 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upp1P52624 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms