Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec1P51908 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms