Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdgfP51859 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HdgfP51859 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HdgfP51859 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HdgfP51859 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms