Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn1swP51491 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms