Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RoraP51448 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RoraP51448 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RoraP51448 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RoraP51448 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RoraP51448 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RoraP51448 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms