Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl9P51410 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl9P51410 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl9P51410 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl9P51410 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl9P51410 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl9P51410 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms