Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms