Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc13P50207 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms