Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CitP49025 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CitP49025 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CitP49025 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CitP49025 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CitP49025 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CitP49025 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms