Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3P48787 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms