Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms