Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sipa1P46062 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sipa1P46062 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms