Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ItgavP43406 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgavP43406 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms