Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-2P42580 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms