Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf9P41274 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms