Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl28P41105 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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