Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox7P40646 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox7P40646 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms