Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms