Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtlP38585 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtlP38585 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtlP38585 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtlP38585 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtlP38585 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms