Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpargP37238 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpargP37238 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpargP37238 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpargP37238 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpargP37238 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms