Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sar1aP36536 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms