Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprkP35822 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprkP35822 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprkP35822 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprkP35822 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprkP35822 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms