Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin1P35438 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin1P35438 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin1P35438 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms