Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2aP35436 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2aP35436 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2aP35436 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms