Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TpoP35419 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TpoP35419 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TpoP35419 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TpoP35419 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TpoP35419 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TpoP35419 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TpoP35419 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TpoP35419 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms