Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp4P35123 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms