Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp12P34960 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms