Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc1P34928 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms