Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd1P33215 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd1P33215 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms