Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc11P31313 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms