Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd28P31041 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd28P31041 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms