Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnd1P30999 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms