Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms