Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msr1P30204 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms