Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casp1P29452 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp1P29452 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms