Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pabpc1P29341 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms