Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif5cP28738 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms