Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RxraP28700 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RxraP28700 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RxraP28700 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RxraP28700 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms