Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IppP28575 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IppP28575 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IppP28575 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IppP28575 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IppP28575 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IppP28575 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IppP28575 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms