Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CebpbP28033 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms