Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav1P27870 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav1P27870 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vav1P27870 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vav1P27870 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms