Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms