Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou2f1P25425 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou2f1P25425 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms