Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd12P23812 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd12P23812 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms